碘化丙啶染色(PI Stain)可以對細胞周期與細胞凋亡進行分析，碘化丙啶(Propidium Iodide, PI)是一種可以嵌合到雙鏈DNA和RNA的堿基對中并與之結合的熒光染料，無堿基特異性。碘化丙啶與雙鏈DNA結合后可以產生熒光，并且熒光強度和雙鏈DNA的含量成正比，細胞內的DNA被Propidium Iodide染色后，可以用流式細胞儀對細胞進行DNA含量測定，然后根據DNA含量的分布情況，可以進行細胞周期和細胞凋亡的分析，碘化丙啶染色后，假設G0/G1期細胞的熒光強度為1，那么含有雙份基因組DNA的G2/M期細胞的熒光強度的理論值為2，正在進行DNA復制的S期細胞的熒光強度為1～2之間。凋亡細胞由于細胞核發生濃縮以及發生DNA片段化(DNA fragmentation)導致部分基因組DNA片斷在染色過程中丟失，因此凋亡細胞碘化丙啶染色后呈現明顯的弱染，即熒光強度小于1，在流式檢測的熒光圖上出現所謂的sub-G1峰，即凋亡細胞峰。

細胞凋亡時流式細胞檢測可呈現亞二倍體核型的特征，根據光散射的特點，PI染色可以區分細胞凋亡和細胞壞死的細胞峰型。細胞凋亡時出現凋亡細胞皺縮、染色質濃縮、核碎裂，產生凋亡小體，使細胞的前向光散射低于正常；在細胞凋亡的早期，細胞對前向角光散射的能力顯著降低，對側向光散射的能力增加或沒有變化；在細胞凋亡的晚期前向和側向光散射的信號均降低；細胞壞死時細胞多表現為細胞腫脹，因此前向光散射高于正常，對側向光散射高于正常。

Leagene碘化丙啶PI染色液(1mg/ml)主要由PI、破膜劑等組成，經常用于培養的貼壁或懸浮細胞的細胞周期與細胞凋亡檢測，亦可用于區分細胞凋亡和細胞壞死，其工作濃度多為20～50μg/ml，不含RNase，推薦用于RNA染色，細胞檢測含量范圍一般為0.1～1×10⁶之間。該試劑僅用于科研領域，不適用于臨床診斷或其他用途。